یکی از قدیمی ترین واحد های شرکت پیگیر واحد جوجه کشی بوده که در محدوده شهرستان آق قلا واقع شده است.
اولین تولید آن در سال 1360 از تخم مرغ های وارداتی از هلند انجام شد.
این واحد هم اکنون دارای 36 دستگاه ستر و 36 دستگاه هچر در 3 سالن مجزاست و توان بارگیری 932400 عدد تخم مرغ نطفه دار را در هفته دارا می باشد.
در سالن های نگهداری جوجه با استفاده از سیستم تهویه مطبوع، دما و رطوبت مناسب نگهداری جوجه ها تا زمان حمل کنترل و تامین می شود.
وظایف واحد آزمایشگاهی مستقر در جوجه کشی از این قرارست:
انجام کلیه آزمایش های میکروب شناسی، قارچ شناسی و تست های حساسیت دارویی
بررسی عملکرد ضدعفونی کننده های مورد استفاده و کنترل کیفیت جوجه های تولید شده